在胃腸腫瘤手術中與吻 (縫)合器使用相關的并發癥包括吻合口漏、 吻合口出血、 吻合口狹窄。但是以上并發癥不僅僅是應用吻合器的問題, 手工吻合也同樣可以出現上述并發癥。吻(縫 )合器的使用大大降低了并發癥的發生率。一次性使用吻合器使用的時候也要注意，防止一些后期出現的并發癥。

1 . 吻合口漏: 吻合口漏是應用吻(縫 )合器手術后的一種嚴重并發癥, 一旦發生, 后果嚴重。隨著吻合器, 特別是雙吻合器技術的應用其發生率有顯著下降。

2 . 吻合口狹窄: 吻合器吻合狹窄發生低于傳統手工吻合。

3 . 吻合口出血: 吻合器吻合釘均為雙層交錯設計, 應用吻合器后吻合口出血已經比較少見, 但在臨床仍然可以遇到。

一次性使用的吻合器的需要也要注意相關的使用注意事項，防止術后出現一些并發癥，影響疾病的治愈。